O conteúdo da matéria orgânica do solo de um solo pode desempenhar um papel fundamental em sua saúde, afetando mais de uma das características mencionadas acima. É a fração do solo que consiste em resíduos de plantas e animais em diferentes estágios de decomposição rica em carbono e nitrogênio (fósforo, enxofre e minerais de rastreamento).
Os solos podem ter de um traço a até 20 a 30% de matéria orgânica. No entanto, um conteúdo entre 1-6% é mais comum na maioria dos solos usados na agricultura.