農業生物多樣性是生物多樣性的一個分支，指的是用於食品和非食品生產的栽培植物、家畜動物和微生物的多樣性，無論是直接使用還是間接使用。農業生物多樣性分為三個層次。
1. 遺傳生物多樣性包括所有栽培品種和動物品種，及單一物種的野生近緣種。農民種植的品種繁多，促進了農業生物多樣性。舊品種和野生近緣種是新品種、雜交品種和混合品種開發的基因庫。
2. 特定農業生物多樣性指的是眾多用於食品的動植物物種。營養全球化和單一作物種植導致種植的物種範圍狹窄，降低了農業生物多樣性和營養質量。
3. 農業生態系統多樣性是指特定地區作物、家畜動物、野草、野生動植物、技術林、樹籬等的多樣性和複雜性。
