大多数农民在第4年后停止种植苜蓿，因为其产量会明显下降（每年可能下降15%）。正如许多其他植物一样，紫花苜蓿也会受到自毒作用的影响。这意味着紫花苜蓿植物自身产生的毒素会抑制同一田地中新生紫花苜蓿植物的生长。因此，在完成收获第4年的紫花苜蓿后，大多数农民通过深耕来破坏掉紫花苜蓿植物，然后在田里播种小麦、玉米或大麦。在收获完当年产的小麦、玉米或大麦后，他们再次播种紫花苜蓿，进行下一个4年的耕作。这种作物轮作对紫花苜蓿和小麦/大麦/玉米都有好处。一方面，谷物会抑制杂草的生长发展，为苜蓿的种植留出田地。另一方面，研究结果表明，种植紫花苜蓿之后的玉米产量比单纯只种植玉米之后的玉米产量高出约10%。
