冠瘿瘤是一种主要影响幼树的疾病，由根癌土壤杆菌杆菌引起。最常见的症状是在土壤线以上或以下的根部形成瘤子（过度生长）。有许多感染虫瘿的树木将逐渐变得无法将水和养分转移到树木的上部。因此，树木会慢慢变得虚弱，最终死亡。这种细菌可以在土壤中生存多年。
核桃枯萎病是一种由核桃细菌性黑斑病菌引起的细菌性疾病。这是最常见的核桃树疾病，直接影响叶子和坚果。它最常出现在春季潮湿的条件下。一些症状表现为，果核收缩、萎缩、木乃伊化或变色。树皮和树叶可能出现病变，而受感染的新芽可能死亡。降雨有利于该疾病的快速传播，因为细菌会通过雨水转移到新的绿色组织并感染它们。
蜜环菌根腐病、疫病菌根腐病和白粉病也是常见的核桃树疾病。
